山东协和学院马克思主义学院是学校独立设置的二级机构，是山东协和学院思想政治理论课教学部门和马克思主义理论研究机构，主要承担全校思想政治理论课及部分人文选修课的教学科研任务。学院内设机构有学院办公室、教学科研科及六个教研室：习近平新时代中国特色社会主义思想概论教研室、马克思主义基本原理教研室、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论教研室、中国近现代史纲要教研室、思想道德与法治教研室、形势与政策教研室。学院开设的课程主要有：《习近平新时代中国特色社会主义思想概论》《思想道德与法治》《中国近现代史纲要》《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》《马克思主义基本原理》《形势与政策》等必修课，以及《书法艺术史》等选修课。
        山东协和学院马克思主义学院是直属学校领导的二级机构，统一开设全校思政课，统一管理思政课教师，统一负责马克思主义理论建设。学院围绕立德树人根本任务，为全校培养有理想、有本领、有担当的中国特色社会主义建设者和接班人铸魂立身，为培养扎根中国大地的马克思主义理论人才精益求精。学院承担全校各专业、各学段的思想政治理论课教学，围绕立德树人根本任务，逐步形成教学改革的协和特色。现有山东省思政金课1门、山东省一流课程1门、校级一流课程5门。在2019年山东省第四届青年政治佳教学比赛中荣获“十佳思政课”荣誉称号，在2020年山东省首届高校思想政治理论课教学大赛中获一等奖、二等奖各1项，在2020年山东省第六届“超星杯”信息化教学大赛获优秀奖1项，在2021年山东省第七届“超星杯”信息化教学大赛中获优秀奖1项，在2021年山东省“基础”课集体备课成果获二等奖1项，在2022年首届山东省教学设计大赛中获一等奖、二等奖各2项；在2022年山东省“同城大课堂”教学选题暨组织开展优秀教学设计征文大赛中获优秀奖2项，在2023年山东省普通高等学校教师教学创新大赛获三等奖1项。
        学院师资队伍结构合理。学院全面贯彻党的教育方针，坚持教书与育人相结合、言传与身教相统一、以德立身、以德立学、以德立教，目前已拥有一支师风道德高尚、理论功底扎实、实践经验丰富的教学科研团队。学院目前有山东省教学名师1人，山东省学校优秀思政课教师1人、山东教育系统优秀共产党员1人、校级三八红旗标兵1人、校级关心下一代工作先进工作者1人。截至2023年6月，学院承担教育部高校思想政治理论课教师研究专项课题1项，省教育厅本科高校教学改革课题3项，省级科研课题4项，厅局级科研课题5项。
        学院高举中国特色社会主义伟大旗帜，以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，坚持“在马言马”，坚持立德树人，着力提升高校思政课教学的思想性、理论性和针对性、亲和力，着力提升马克思主义中国化研究的国际传播力和影响力。学院坚持以“政治立院、制度建院、科研兴院、人才强院”为核心理念，以服务国家和地方发展战略为使命，以教学为中心，以科研为支撑，以队伍建设为重点，以“坚持真理、崇尚学术、服务社会、追求卓越”为宗旨，全面提升思想政治理论课的教育教学质量和马克思主义理论的科研水平，努力将马克思主义学院建成在省内外有一定影响力和示范作用的高水平马克思主义学院。学院将沿着“思政引领、德艺并进”的路径，努力建设在马克思主义理论的教育教学、科学研究、人才培养等领域具有协和特色、山东特点、全国影响力的重要基地。