中心大部分实验教学系统的开发采用校企合作开发形式。学校从学科、专业实践教学需求出发，进行系统开发的架构与内容设计。企业提供虚拟仿真开发支持，并接受学校方面的学科专业内容与知识指导。双方共有开发成果的知识产权，双方共享成果推广与成果奖励的收益。共同开发的优势在于降低开发成本、提高开发效率、保证开发质量。具体操作方式为：学校配套开发场地与设施，技术人员直接进驻设备、医院现场，并且与学科专业团队面对面实施系统的开发。

    企业给出实验教学系统原型产品，然后纳入中心的教学平台，同时冠名为校企联合共建实验室或实验系统。产品通过在平台上的应用完成优化设计，使产品更加成熟。同时借助平台实现产品推广。

    中心资源对社会开放，实现有偿资源共享。发挥学校和企业各自优势，由企业主要负责各教学系统的市场推广。推广收益由校企进行合理分配。校企通过共同开发、共建实验室、市场运作等多种方式对中心进行持续投入，保证了中心的健康、持久发展。